在 九千 隻 上下 ， 包括 白眉 燕鷗 、 鳳頭 燕鷗 、 紅 燕鷗 、 蒼 燕鷗 、 黑尾鷗 、 岩鷺 、 叉 尾 雨燕 等 七 種 ， 其中 ， 黑尾鷗 的 繁殖 紀錄 為 全 國 獨一無二 ， 珍貴 無比 ， 白眉 燕鷗 、 蒼 燕鷗 為 保育類 ， 紅 燕鷗 被 歐美 國家 列為 瀕臨 絕種 鳥類 ， 鳳頭 燕鷗 數量 則 為 全 國 之 冠 。 另外 ， 紅 喉 潛鳥 、 大水薙鳥 、 穴鳥 、 短尾 水薙鳥 、 丹氏 鸕鶿 、 黑 頸 鷿舁 、 海秋沙 、 唐白鷺 等 稀有 鳥類 ， 也 有 在 島 上 停留 的 紀錄 。 擬 畫為 保護區 的 各 列島 ， 都 是 無 人 島嶼 ， 屬 未 登錄 土地 ， 鄰近 海域 漁場 資源 豐富 ， 但 大部分 均 為 大陸 漁民 所 壟斷 ； 島礁 上 盛產 治 風濕痛 的 海芙蓉 、 各 類 海螺 、 筆架 等 海產 ， 因此 ， 每 年 夏季 都 吸引 兩岸 不少 漁民 登岸 撿 取 。 因於 保護區 大多 曾 為 國軍 演習 時 的 砲擊 目標 ， 因此 ， 島嶼 的 原始 風貌 及 海鳥 的 棲息 環境 曾 受 嚴重 影響 ， 甚至 造成 大量 燕鷗