， 分 屬 衛生署 轄下 的 防疫處 、 檢疫 總 所 、 預防 醫學 研究所 管轄 。 防疫處 掌管 傳染病 相關 的 防止 、 調查 、 研究 及 處理 等 事項 ； 檢疫 總 所 負責 國際 疫情 的 蒐集 、 交換 、 疫情 調查 及 報告 ， 支援 地方 衛生 機關 辦理 傳染病 防治 等 事項 ； 預防 醫學 研究所 則 負責 疫苗 製造 、 病媒 以及 病毒 的 研究 、 檢驗 工作 。 至於 地方 的 衛生局 防疫科 ， 絕大多數 都 不 是 傳染 流行病 專業 人員 。 金傳春 教授 指出 ， 我國 防疫 系統 紊亂 ， 中央 在 多頭 馬車 、 分工 不清 的 情況 下 ， 不 是 互相 搶功 ， 就是 互 踢 皮球 。 連 曾經 來 台 訪問 的 美國 疾病 管制 中心 疫情 週報 編輯 主任 古德曼都 說 ： 「 在 如此 多 不同 單位 中 ， 台灣 可以 控制 疫病 多 年 ， 也 是 個 奇蹟 。 」 在 此 次 腸病毒 疫情 之後 ， 衛生署 有意 將 三 個 中央 單位 整合 ， 成立 「 疾病 管制局 」 ， 以 統籌 事權 。 並 著手 修訂 「 傳染病 防治 條例 」 ， 將 原本 十一 項 法定 傳染病 增加為 三十六 項