， 有些 蝦 池 來自 農業 、 虱目魚池 、 木 場 或 礦區 。 儘管 如此 ， 水產 養殖 加速 了 沿岸 野生 蝦 、 石斑 、 海水 鱸魚 、 蟹 、 烏魚 、 虱目魚 和 鯛類 或 其它 種類 之 棲息地 的 和 惡化 。 水產 養殖 用 人工 池 養 魚 ， 常常 要 和 農業 競爭 用水 ， 會 使 水 資源 的 利用 更加 吃緊 。 水 是 生長 、 補充 氧氣 和 將 廢物 從 水產 養殖 系統 中 移除 的 媒介 。 大體 上 ， 高密度 生產 鯉魚 和 吳郭魚 需要 大約 相同 的 水 。 每 １ 噸 魚 所 需要 的 水 ， 相當於 養 吃 穀類 的 牛 和 豬 所 耗用 的 水量 。 養 １ 噸 魚 要 消耗 ８ 噸 的 水 ， 相較 於 １ 噸 豬肉 需 ５ 噸 水 ， 而 一 噸 餵 穀類 的 牛肉 則 需要 ８．５ 噸 的 水 ） 。 但是 蝦類 集約式 養殖 是 養殖 一般 魚類 耗 水 的 １０ 倍 。 這會 對 當地 的 供水 造成 非常 大 的 壓力 。 取代 野生 棲地 ， 已經 對 野生 的 捕撈量 造成 可 預期 的 影響 ， 例如 在 印度 近海 村莊 ， 漁民 反映 ， 在 養 蝦 池 興建 完成 一 年 後 ， 野生 魚類 的 收 獲 量 就 縮減 了 １０ 倍 。 在 孟加拉 的 「 Ｓｕｎｄａｒｂａｎｓ 」 地區 ， 因為 剷除 紅樹林 興建 養 蝦 池 ， 改變 淡水 和 海水 的 交流 ， 使得 漁民 感受到 野生 捕撈量 下降 了 約 ８０％ 。 最 嚴重 的 壞 記錄 是 發生 在 泰國 ， 在 １９８０年 大量 養 蝦 池 的 ， 造成 全 國 有 一半 的 紅樹林 消逝 ； 雖然 這些 養 蝦 池 每 年 可 出產 １２萬 噸 的 養殖 蝦子 ， 但 卻 造成 野生 魚 的 捕獲量 減少 了 ８０萬 噸 。 養殖 肉食性 魚種 ， 如 鰻魚 、 鮭魚 、 蝦子 或 鱒魚 ， 這些 都 會 對 野生 魚類 造成 巨大 的 壓力 。 因為 肉食 魚類 需要 從 其它 魚種 獲取 成長 所 需 的 氨基酸 （ 蛋白質 ） ， 這些 養殖 時 所 餵食 的 高 蛋白質 飼料 ， 就是 從 野生 的 魚種 所 作成 的 。 養殖 １ 公斤 的 鮭魚 或 蝦子 ， 就 要 消耗 ５ 公斤 來自 海洋 魚類 所 作成 的 魚 粉 。 在 柬埔塞 、 泰國 、 和 越南 南部 的 內陸 ， 養殖業 幾乎 完全 以 小型 野生 魚類 做為 飼料 ， 而 這些 小魚乾 製 後 ， 也 是 一般 窮困 人家 的 食物 。 養殖業 消耗 全 世界 魚肉 產量 的 ２０％ ， 這 是 造成 過度 撈捕 的 禍首 。 事實 上 ， 每 年 有 ６００萬 噸 的 野生 海洋 漁獲量 是 被 用來 餵食 養殖 魚種 。 可以 預期 至 ２０１０ 年前 ， 全 世界 將 會 有 更多 的 魚肉 是 被 用來 飼養 高 經濟 價值 的 肉食 魚種 。 如果 魚類 直接 用來 提供給 人類 食用 而 非 被 其他 魚 捕食 ， 這 對 人類 是 比較 有 好處 的 。 養殖業 並 不會 只 對 陸地 和 食物 有所 需求 ， 其 對 海洋 魚類 也 會 造成 威脅 。 魚池 若 管理 失當 ， 也 會 有 可能 「 漏出 」 到 四周 的 地區 。 因為 魚類 生活 在 水 中 ， 牠們 的 排泄物 、 殘 餌 若 不 加以 處理 ， 則 會 直接 進入 水 中 。 「 蘇格蘭 」 的 研究員 估計 ： 每 噸 養殖 魚 會 產生 將近 １ 噸 的 排泄物 。 雖然 這些 排泄物 大部分 是 無 毒 的 ， 但 這些 養分 充足 的 排泄物 卻 會 使 水體 優養化 及 藻類 大量 繁衍 。 在 英國 、 美國 、 加拿大 等 地 的 集約式 鮭魚 養殖場 ， 產生 廢棄物 的 量 相當於 一 個 ５０萬 人 居住 之 城市 所 排出 的 量 。 另 一 個 水產 養殖 對 野生種 的 威脅 是 因為 養殖 魚類 （ 包括 馴養 或 養殖 之 魚種 ） 逃脫 至 河川 、 湖泊 或 沿海 區域 所 造成 。 這些 逃脫 的 魚類 可能 會 吃掉 野生種 ， 或 與 野生種 競爭 食物 ， 甚至 在 某些 區域 完全 取代 野生種 ， 因而 稀釋 野生種 之 基因庫 。 挪威 科學家 在 最近 的 一 篇 報導 中 指出 ， 在 四 尾 洄游 產卵 的 鮭魚 中 ， 即 有 一 尾 源自 養殖場 。 鮭魚 最 易成 為 取代 的 犧牲 者 ， 因為 野生 鮭魚 之所以 能 生存 於 大自然 荒野 中 ， 主要 是 牠們 有 洄游到 其 出生地 產卵 的 特色 。 養殖 的 鮭魚 ， 因 其 被 飼養 在 箱網 中 ， 所以 沒 能 發展出 此 洄游 的 形質 。 一旦 養殖 鮭魚 與 野生種 鮭魚 交配