由於 一向 宗門徒 堅決 反抗 ， 大概 幾乎 沒有 戰果 吧 ！ 16 日信長 決定 撤退 ， 但 在 撤退 戰 中 原本 負責 殿後 的 柴田勝家 受傷 ， 取而代之 的 美濃 三 人 眾 之 一 的 氏家 卜 全 卻 戰死 ， 堪稱 慘敗 。 比 叡山 燒 討 由於 攻打 伊勢 長島 慘敗 ， 信長 想必 了解 了 一向 一 揆 的 頑強 和 可怕 ， 同時 卻 更 堅定 他 和 宗教 勢力 對抗 的 決心 。 在 此 之後 ， 有 一 段 時間 信長 陷入 困境 。 一 到 6 月 ， 本願寺 宗主 顯 如 長子 教 如 ， 確定 與 朝 倉義 景 之 女 的 婚事 ， 強化 本願寺 與 朝倉氏 的 關係 。 由於 義景 之 母 廣德院 出身 武田氏 ， 此 事 意義 重大 。 三 好 三 人 眾 也 益發 活躍 ， 起初 與 三 好 三 人 眾 聯手 之後 投靠 信長 的 松永久秀 ， 也 開始 出現 暗自 與 武田信玄 聯絡 的 奇怪 舉動 。 久秀 才華 出眾 ， 因此 得以 在 戰國 亂世 中 生存 。 從 他 出現 奇怪 舉動 一 事 ， 不 難 了解 信長 的 窘境 。 面對 如此 艱難 的 情況 ， 信長 決定 燒毀 比叡山 。 元龜 2年 （ 1571 ） 8 月 信長 進攻 北近江 ， 26 日 晚上 燒毀 余吳和木 之 本 （ 皆 在 滋賀縣 伊香郡 ） 一帶 ， 之後 沿 琵琶 湖 東岸 往 南方 移動 。 9 月 1 日 攻打 歸順六角氏 的 小 川和志村 二 城 （ 滋賀縣 神崎郡 能登川町 ） ， 砍下 670 顆 敵軍 首級 。 3 日 進入 常樂寺 ， 攻陷 由 一向 一 揆 鎮守 的 金森城 （ 滋賀縣 守 山市 ） 。 信長 接著 命 諸 將 前往 南方 ， 11 日 抵達 三井寺 。 9 月 12 日 早上 率領 3萬 大軍 突然 攻入 本 ， 隨即 放 火 燒 城 。  本 相當於 比叡山 大門 ， 為 當時 近 江 首屈一指 的 城市 ， 有 眾多 延曆寺 的 堂舍 。 整 個  本 市區 頓時 陷入 一 片 火海 ， 信長 更 進一步 燒毀 位於 郊外 的 日吉神社 ， 接著 攻上 比叡山 ， 將 山 中 以 根本 中堂 為首 的 佛堂 、 僧房 和 藏經閣 等 建築 燒 得 一乾二淨 。 因為 一 天 燒 不 完 ， 火 一直 放到 15 日 連續 燒 了 四 天 。 而 織田軍 在 信長 的 命令 下 殺 了 所有 四處 逃竄 的 人 ， 不 只 是 僧侶 ， 連同 山 下 逃 上山 來 的 一般 百姓 也 不 放過 ， 小孩 和 女人 同樣 照 殺 不誤 。 由於 延曆寺 算是 聖地 ， 因此 信 長 的 手下 如 佐 久 間 信 盛 等 人 反對 放火 ， 秀吉 更 無視於 信長 的 命令 故意 讓路 給 眾人 逃命 。 話 雖 如此 ， 大多數 人 還是 聽從 信長 的 命令 ， 因此 據傳 當時 包括 僧侶 和 一般 百姓 在 內 ， 有 三 、 四千 人 遭到 殺害 。 這 雖然 非常 殘酷 ， 但 一 年 前 的 9 月 12 日 ， 正好 是 本願寺 突擊 正在 與 三 好 軍 交戰 的 信 長軍 的 日子 。 井澤元彥 先生 指出 ， 燒 討 延曆寺 具有 警告 本願寺 的 意味 ， 或許 是 因為 有 這樣 的 打算 ， 所以 才 會 破壞 得 如此 徹底 。 當然 也 有 可能 是 在 實踐 去年 如果 支持 淺井 和 朝 倉 ， 將 全數 燒毀 位於 比叡山 上 所有 延曆寺堂舍 的 諾言 。 自 平安 時代 以來 日本 最 大 的 佛教 勢力 ， 有時 甚至