月 信長 進攻 北近江 ， 26 日 晚上 燒毀 余吳和木 之 本 （ 皆 在 滋賀縣 伊香郡 ） 一帶 ， 之後 沿 琵琶 湖 東岸 往 南方 移動 。 9 月 1 日 攻打 歸順六角氏 的 小 川和志村 二 城 （ 滋賀縣 神崎郡 能登川町 ） ， 砍下 670 顆 敵軍 首級 。 3 日 進入 常樂寺 ， 攻陷 由 一向 一 揆 鎮守 的 金森城 （ 滋賀縣 守 山市 ） 。 信長 接著 命 諸 將 前往 南方 ， 11 日 抵達 三井寺 。 9 月 12 日 早上 率領 3萬 大軍 突然 攻入 本 ， 隨即 放 火 燒 城 。  本 相當於 比叡山 大門 ， 為 當時 近 江 首屈一指 的 城市 ， 有 眾多 延曆寺 的 堂舍 。 整 個  本 市區 頓時 陷入 一 片 火海 ， 信長 更 進一步 燒毀 位於 郊外 的 日吉神社 ， 接著 攻上 比叡山 ， 將 山 中 以 根本 中堂 為首 的 佛堂 、 僧房 和 藏經閣 等 建築 燒 得 一乾二淨 。 因為 一 天 燒 不 完 ， 火 一直 放到 15 日 連續 燒 了 四 天 。 而 織田軍 在 信長 的 命令 下 殺 了 所有 四處 逃竄 的 人 ， 不 只 是 僧侶 ， 連同 山 下 逃 上山 來 的 一般 百姓 也 不 放過 ， 小孩 和 女人 同樣 照 殺 不誤 。 由於 延曆寺 算是 聖地 ， 因此 信 長 的 手下 如 佐 久 間 信 盛 等 人 反對 放火 ， 秀吉 更 無視於 信長 的 命令 故意 讓路 給 眾人 逃命 。 話 雖 如此 ， 大多數 人 還是 聽從 信長 的 命令 ， 因此 據傳 當時 包括 僧侶 和 一般 百姓 在 內 ， 有 三 、 四千 人 遭到 殺害 。 這 雖然 非常 殘酷 ， 但 一 年 前 的 9 月 12 日 ， 正好 是 本願寺 突擊 正在 與 三 好 軍 交戰 的 信 長軍 的 日子 。 井澤元彥 先生 指出 ， 燒 討 延曆寺 具有 警告 本願寺 的 意味 ， 或許 是 因為 有 這樣 的 打算 ， 所以 才 會 破壞 得 如此 徹底 。 當然 也 有 可能 是 在 實踐 去年 如果 支持 淺井 和 朝 倉 ， 將 全數 燒毀 位於 比叡山 上 所有 延曆寺堂舍 的 諾言 。 自 平安 時代 以來 日本 最 大 的 佛教 勢力 ， 有時 甚至 有 左右 政治 權力 的 延曆寺 ， 就 這樣 在 信長 面前 全 毀 。 由於 領地 也 遭 奪取 ， 延曆寺 可 說 消失 在 這 個 世界 上 了 。 信長 將 延曆寺 的 領地 賜給 明智光秀 、 柴田勝家 和 佐久間信盛 等 部將 ， 鞏固 江南 的 統治 。 自古以來 被 稱為 「 王城 守護 」 的 延曆寺 遭到 破壞 ， 確實 讓 當時 的 百姓 十分 恐懼 訝異 ， 甚至 有 朝 臣 在 日記 中 記載 信長 所為 是 「 天魔 的 行為 」 ， 武田信玄 也 批評 信長 。 即使 如此 ， 也 有 不少 人 認為 延曆寺 滅亡 是 莫可奈何 的 事 。 因為 延曆寺 僧眾 原本 應 為 修行 者 ， 但 當時 眾多 僧眾 住 在  本 胡作非為 ， 在 某 種 意義 上 延曆寺 的 佛法 早已 不 存在 。 此外 ， 在 永祿 10年 （ 1567 ） 松 永久秀 與 三 好 三 人 眾 開戰 之 際 ， 也 曾 發生 燒毀 東大寺 大 佛殿 的 意外 。 因此 放火 燒毀 延曆寺 對 當時 的 人 而 言 ， 也 非 絕對 不可能 的 事 。 後來 的 研究 者 和 歷史學家 對 信長 比 叡山 燒 討 一 事 有 極 高 的 評價 。 江戶 時代 的 儒者 新 井