與 清朝 分治 中國 。 皇帝 對 喇嘛 的 請求 ， 給予 快速 地 批駁 以及 堅毅 地 用兵 的 回應 。 經過 八 年 苦戰 ， 平息 了 三 藩 戰亂 ， 得到 最後 的 勝利 ， 國家 沒有 分裂 ， 在 「 國惟一 主 」 的 情形 下 ， 進入 了 有 秩序 、 有 紀律 的 常規 況態 。 三 藩 變 亂 平定 之後 ， 只有 在 台灣 的 鄭氏 抗 清 了 。 鄭氏 祖孫 三代 都 是 因為 與 清朝 政府 的 政治 理念 與 目的 不同 才 反清 的 。 他們 除了 與 清朝 不斷 作戰 外 ， 也 舉行 過 和談 ， 只是 和談 始終 沒有 成功 。 清 政府 一直 希望 鄭家 在 清朝 的 統一 政府 下 做官 ， 甚至 給 他們 土地 、 封爵 以及 一些 其他 的 特權 。 鄭氏 則 要 比照 朝鮮 或 安南 一樣 ， 不 剃髮 、 不 聽 調遣 命令 ， 而 有 自主 的 地位 。 清 政府 認為 鄭氏 是 福建 的 中國人 ， 不能 與 朝鮮 外國人 相比 ， 不能 同意 ， 最後 以 武力 解決 問題 。 康熙 皇帝 堅決 主張 用 兵 ， 征 討 台灣 ， 因為 鄭氏 「 猶 梗 王化 」 ， 他們 不 承認 「 民無二王 」 ， 而 自己 想 在 海外 稱王 。 康熙 時代 ， 西洋 傳教士 來 華 的 人 很多 ， 皇帝 最初 對 他們 的 態度 也 很 好 。 儘管 皇帝 不 信 他們 的 宗教 ， 但 並 沒有 限制 他們 傳教 。 尤其 皇帝 喜愛 他們 的 科學 知識 ， 所以 任命 西洋 傳教士 做 欽天監 的 官員 ， 掌理 天文 曆法 等 事務 。 他 自己 又 向 傳教士 學習 數學 、 理化 、 天文 、 醫學 、 語文 、 音樂 等 學問 。 一度 極為 信任 西醫 ， 為 他 看病 ， 並 在 宮廷 中 設廠 製藥 。 又 鼓勵 傳教士 翻譯 西書 為 滿 漢文 ， 做 了 不少 中 西 文化 交流 的 工作 。 康熙 對 西洋 傳教士 如此 待遇 ， 主要 是 當時 的 傳教士 們 允許 中國 教徒 祭天 祭祖 祭孔 ， 而且 又 遵行 清朝 法律 ， 皇帝 認為 他們 為 中國 百姓 祈福 求 平安 ， 與 佛道 兩 教 無異 ， 當然 應該 一視同仁 ， 允許 「 將 各 處 天主堂 俱 照舊 存留 ， 且 進香 供奉 之 人 仍 許 照常 行走 ， 不必 禁止 」 。 可是 到 了 康熙 四十六年 以後 ， 皇帝 態度 改變 了 ， 對 一些 傳教士 產生 了 惡感 ， 最後 竟 下令 禁教 。 這 其中 的 原因 ， 主要 的 是 天主教 傳教士 發生 了 內訌 ， 有 人 向 羅馬 教廷 報告 在 中國 的 傳教 人 准許 中國 信徒 敬 拜 偶像 、 祭祖 祭孔 ， 這 是 違反 天主教規 教義 的 。 教皇 乃 下令 叫 在 中國 傳教 的 此後 不准 拜 偶像 ， 否則 逐出 教會 ， 並 讓 教堂 裡 懸掛 的 康熙 御書 「 敬 天 」 二 字 匾額 也 必須 拆下 。 派來 的 專使 不 聽 皇帝 的 勸告 ， 態度 與 言論 都 蔑視 中國 的 皇權 與 法律 。 康熙 認為 西洋 教士 既已 干涉 中國 內政 ， 破壞 中國 敬天 祭祖 的 國本 ， 又 以 皇教 之 權 高於 一切 ， 康熙 皇帝 根本 不能 「 國惟 一主 」 了 ， 當然 必得 把 教廷 的 專使 逐出 國境 ， 西洋 天主教 也 不能 准許 傳布 了 。 不但 外國人 不能 對 康熙 「 國惟一 主 」 的 主張 挑戰 ， 就 是 他 自己 的 兒孫 也 不能 不 承認