1989 急診 成立 「 專科 主治 醫師制 」 ， 並 開始 培訓 「 急診 專科 醫師 」 。 1991 7 月 2 日 ， 林口 長庚 醫院 完成 醫院 首 例 心臟 移植 手術 。 由於 多 人 同時 捐贈 器官 ， 林口 、 基隆 、 高雄 三 院區 同步 進行 器官 移植 手術 。 1993 林口 兒童 醫院 開幕 。 1994 6 月 17 日 ， 高雄 長庚 醫院 完成 醫院 首 例 活體 肝臟 移植 手術 。 8 月 26 日 ， 林口 長庚 醫院 完成 醫院 首 例 骨髓 移植 。 1995 高雄 兒童 醫院 開幕 。 12 月 1 日 ， 林口 長庚 醫院 完成 世界 首 例 以 內視鏡 實施 心臟 內部 的 開心 手術 。 1996 研擬 成立 中醫 臨床 服務 部門 ； 並 在 長庚 醫學 暨 工程 學院 醫學院 籌設 中醫藥 學系 、 所 。 7 月 1 日 ， 林口 院區 成立 中醫部 ， 並 自 8 月 1日 起 開辦 中醫 門診 業務 。 1997 8 月 1 日 ， 長庚 醫學 暨 工程 學院 經 核准 ， 自 8 月 1日 起 改制為 長庚 大學 ， 由 張昭雄 教授 擔任 代理 校長 。 9 月 11 日 ， 林口 兒童