嘌呤 取代 ， 導致 下 一 輪 的 複製股 產生 互補性 的 變化 。 他 想 把 這 種 置換 稱為 顛換 （ transversion ） 。 看起來 ， 這些 突變 似乎 無法 受到 鹼基 類似 物 所 逆轉 ； 他 認為 ， 大部分 自發性 突變 都 屬於 顛換 。 原黃素 突變 也 是 一樣 。 原黃素 的 反應 機制 當時 仍然 未知 。 比起 轉位 突變 ， 弗里斯 所 能 描述 的 顛換 機制 要 模糊 得多 ， 但是 他 認為 ， 這 個 想法 也 為 密碼 問題 提供 了 一 線 曙光 ： 或許 有 辦法 找出 與 各 種 鹼基 置換 類型 相關 的 各 組 胺基酸 變化 。 弗里斯 的 演講 引發 梅索森 、 班塞 、 克里克 等 人 的 熱烈 討論 ， 也 引起 眾人 對 這些 具體 細節 的 讚美 。 最 有 意義 的 新 證據 則 來自 布瑞納 。 「 我 想 ， 我 應該 把 愛麗絲‧歐加爾 （ Alice Orgel ） 發現 的 一 項 結果 告訴 大家 。 」 布瑞納 說 。 愛麗絲 是 歐加爾 的 太太 ， 當時 在 劍橋 工作 。 「 到 目前 為止 ， 所有 由 溴尿嘧啶 引發 的 突變種 都 不會 被 原黃素 逆轉 。 」 這 是 一 套 弗里斯 沒有 做 過 的 補充 實驗 ， 而 它 把 兩 種 誘變劑 的 作用 方式 區分 得 更 清楚 了 。 「 有 一點 應該 要 強調 ， 」 布瑞納 當時 警告 大家 ， 「 我 和 班塞 一起 用 原黃素 引發 突變 的 誘變劑 研究 中 ， 沒有 人 發現 任何 一 處 突變 與 溴尿嘧啶 （ 所 引起 的 突變 ） 位置 相同 。 我 想 ， 這 一 點 意義 重大 。 」 沉澱期 之後 的 新 路徑 接下來 ， 除了 幾 個 實驗室 轉而 嘗試 新 誘變劑 ， 以及 測試 突變種 能否 進行 逆轉 突變 之外 ， 突變 研究 的 速度 又 慢 了 下來 ， 往後 十八 個 月 幾乎 呈現 停滯 狀態 。 到 了 一九五九 到 六○年 的 冬季 ， 從 科羅拉多 大學 前去 卡文迪西 的 生化學家 勒曼 （ Leonard Lerman ） 總算 找出 一 條 途徑 ， 顯示 ?
 
啶類 可能 會 影響 DNA 。 勒曼 認為 ， 這 種 染料 分子 藉由 滑進 相鄰 的 鹼基 對 之間 而 與 DNA 結合 ， 就 像 一 個 塑膠 輔幣 插進 一 疊 銅板 間 ， 迫使 相鄰 鹼基 改以 六點八 埃 的 距離 相隔 ， 而 非 原本 的 三點四 埃 。 「 但是 在 那 段 期間 ， rII 方面 的 研究 乏善可陳。 」 布瑞納 說 。 接著 ， 信使 RNA 顛覆 了 密碼 研究 領域 。 克里克 和 布瑞納 立刻 看出 這 一 點 。 「 這 個 嘛 ， 我 是 指 那 一 刻 ， 就 是 我 從 帕沙第納 回來 的 那 一 刻 ， 我 告訴 法蘭西斯 （ 克里克 ） 這 是 真 的 ， 」 布瑞納 說 ， 「 我們 之前 已經 討論 過 ， 就 在 四月 之後 … … 而 那 意謂 著 遺傳 訊息 一定 是 直接 拷貝 自 DNA 。 因此 ， 密碼 必須 是 簡併 的 。 」 原本 糾纏 不清 的 謎團 突然 找到 一 個 新 的 出口 ， 一一 解開 纏繞 。 第一 步 ， 信使 RNA 解決 了 下列 事實 所 呈現 的 兩難 情境 ： 比對 不同 的 物種 ， 發現 DNA 鹼基 組成 的 差別 變化 極 大 ， 可是 它們 體 內 大部分 的 RNA 卻 差異 很 小 ， 而 蛋白質 的 胺基酸 組成 雖然 不同 ， 但 差異 也 極 小 。 這 是 因為 如果 核糖體 很 穩定 且 不 具 專一性 ， 再 加上 只有 短命 的 信使 RNA 負責 攜帶 DNA 資訊 ， 那麼 不同 物種 的 RNA 組成 範圍 會 這麼 狹窄 不只 很 合理 ， 而且 再 普通 不過 了 。 真正 重要 的 地方 ， 乃是 構成 信使 RNA 片段 的 鹼基 成分 。 既然 信使 RNA 必須 準確 地 隨著 DNA 變化 ， 唯一 有 可能 打通 「 DNA 製造 RNA 製造 蛋白質 」 這 條 路 的 ， 就 只有 假設 「 遺傳 密碼 具有 同義字 」 。 那麼 來 看看 這樣 假設 能 打開 什麼 樣 的 局面 。 如果 密碼 是 簡併式 ， 而且 真的 以 鹼基 三 聯體 來 攜帶 密碼 ， 那麼 所有 可能 的 三聯體 組合 共有 六十四 種 ， 則 密碼 超過 二十 種 組合 將 是 很 合理 的 ，況且 這 套 密碼 不可能 沒有 標點符號 。 如果 有 標點符號 ， 則 一定 得 從 某 個 標示 過 的 固定 起點 開始 讀取 遺傳 密碼 。 信使 RNA 假說 雖然 還 沒有 發表 ， 但是 它 的 結果 藉由 信件 及 口 耳 相傳 已經 傳開來 了 。 一九六○年 秋天 ， 克里克 在 美國 待 了 一陣子 ， 然後 於 十一月 十四日 回到 卡文迪西 ， 也 就是 布瑞納 做完 信使 RNA 對照組 實驗 的 幾 週 後 。 接下來 幾 個 月 ， 愛麗絲‧歐加爾 試遍 了 rII 區 所有 不能 被 鹼基 類似 物 逆轉 的 自發性 突變 ， 發現 它們 果真 能 被 原黃素 逆轉 ， 正 如 弗里斯 的 想法 所 認定 的 。 此外 ， 她 和 布瑞納 也 證明 有 好幾 種 其他 的 ?啶 化合物 可 作為 誘變劑 。 而 不變 的 是 ， 無論 由 ?啶類 製造 的 突變種 或 由 鹼基 類似 物 製造 的 突變種 ， 都 無法 讓 對方 發生 逆轉 突變 。 另外 還 有 一 項 也 不變 ， 這 兩 類 誘變劑 作用 在 基因 圖譜 上 的 位置 不 相同 ， 正 如 布瑞納 在 布魯克 海文 的 聽眾席 對 弗里斯 說 過 的 。 不過 rII 基因 的 奇特 之 處 在於 ， 它 所 製造 的 蛋白質 在 當時 仍然 無法 分離出來 ， 最 可能 的 原因 或許 是 它 是 某 種 酵素 ， 不 屬於 噬菌體 身 上 的 任何 一 個 部分 。 布瑞納 和 芭內特 也 試驗 已 知 負責 噬菌體 某些 部位 蛋白質 的 基因 ， 例如 尾 纖維 基因 ； 他們 期盼 了 好幾 年 ， 想 藉 此 證明 密碼 與 蛋白質 的 共線性 ， 進而 解開 密碼 。 然而 他們 有點 驚訝 地 發現 ， 鹼基 類似 物 很 容易 讓 這 類 基因 產生 突變 ， ?
 
啶類 卻 很 難 ， 甚至 完全 不會 。 又 一 次 知名 的 午餐 討論 而 從 「 無 標點符號 」 監獄 中 解放出來 後 ， 克里克 和 布瑞納 提出 一 個 與 弗里斯 相反 的 想法 ， 想法 的 起點 在於 兩 類 誘變劑 所 製造 的 突變 基因 圖譜 竟然 一點 都 不 相像 。 「 兩 年 來 ， 它 一直 深深 困擾 著 我們 。 」 布瑞納 說 。 克里克 從 美國 回來 後 ， 某 天 中午 在 老鷹 酒吧 吃 午餐 時 （ 這 是 生物學史 上 這 類 知名 午餐 的 最後 一 頓 ） ， 先 是 布瑞納 推測 ， 而 克里克 馬上 接手 ： ?
 
啶 之所以 具有 誘變 功能 ， 是 因為 它 能 插入 或 刪去 一 個 鹼基 對 。 這 個 機制 很 容易 想像 ； 他們 將 勒曼 的 想法 又 往 前 推進 半 步 ， 認為 ?啶類 染料 分子 有時 會 滑進 DNA 某 一 股 的 相鄰 鹼基 對 之間 ， 但